A instituição conta com comitês responsáveis por assegurar que todas as atividades de ensino, pesquisa e extensão sejam conduzidas com responsabilidade, respeito e integridade. O Comitê de Ética em Pesquisa (CEP) e a Comissão de Ética no Uso de Animais (CEUA) atuam na avaliação, orientação e acompanhamento de projetos, garantindo que normas éticas e legais sejam cumpridas.

O Comitê de Ética em Pesquisa com Seres Humanos (CEP/CONEP) é um colegiado interdisciplinar e independente, com função pública, de natureza técnico-científica, existente nas instituições que realizam pesquisas envolvendo seres humanos no Brasil, e que, por possuir relevância pública, é de caráter consultivo, deliberativo e educativo, criado para defender os interesses dos participantes da pesquisa em sua integridade e dignidade, contribuindo, incisivamente, no desenvolvimento das pesquisas dentro dos padrões éticos, com envolvimento de seres humanos, exceto animais.

A Comissão de Ética no Uso de Animais (CEUA) é responsável pela a análise de todos os protocolos de pesquisa e ensino que utilizem animais dentro da Universidade Federal de Rondonópolis, constituído como um órgão colegiado, de caráter consultivo, multidisciplinar, deliberativo e educativo. A comissão é um órgão permanente e independente, estando vinculada à Vice Reitoria da UFR

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