Com o objetivo de melhorar a transparência da aplicação dos recursos orçamentários da Universidade Federal de Rondonópolis e consequentemente melhorar a adoção de boas práticas de governança e indicadores de Governança Pública Organizacional estabelecidos pelo Tribunal de Contas da União – TCU, a Universidade Federal de Rondonópolis utiliza o alinhamento da execução orçamentária das despesas discricionárias com o planejamento estratégico da organização. Esse mecanismo permite monitorar o cumprimento das metas dos planos estratégicos vinculado à disponibilização de recursos orçamentários com vista ao princípio da economicidade. A vinculação dos recursos orçamentários discricionários aos objetivos estratégicos assegura que as ações estejam alinhadas aos planos e diretrizes institucionais. 

Além de melhorar a transparência da aplicação dos recursos orçamentários, o alinhamento entre a execução orçamentária com o planejamento estratégico possibilita maior clareza para fundamentar a elaboração da proposta orçamentária para o exercício seguinte.